DNA Script, l’inventeur de la première imprimante enzymatique d’ADN de paillasse : Rencontre avec son CEO et cofondateur, Thomas Ybert

Thomas Ybert (au millieu), Sylvain Gariel (à droite) et Xavier Godron (à gauche), les 3 cofondateurs de DNA Script, inventeur de la première imprimante d'ADN

Fondée en 2014, DNA Script est une entreprise technologique qui développe une technologie innovante de synthèse d’ADN. Grâce à ses innovations, elle donne naissance à SYNTAX™️, la première imprimante d’ADN de table au monde, alimentée par la technologie enzymatique.

Pour le Journal du Manager, Thomas Ybert, son CEO et cofondateur, raconte l’histoire de DNA Script.

Quelle est l’histoire de DNA Script ? Pourquoi avez-vous inventé le système SYNTAX ? 

La société a été cofondée par Sylvain GarielXavier Godron et moi. Pour nous, l’ADN synthétique largement accessible est la clé pour améliorer la santé humaine, atténuer le changement climatique, rendre l’agriculture plus durable et résoudre d’autres problèmes difficiles. 

Avant de lancer DNA Script, nous avions chacun une expérience personnelle de la recherche en utilisant des fournisseurs de services d’ADN tiers. Cette externalisation constituait un goulot d’étranglement important qui ralentissait nos recherches. Réalisant que le problème ne pouvait pas être résolu avec les méthodes traditionnelles de synthèse chimique, nous avons commencé à explorer le développement d’une solution enzymatique.

Notre vision est de donner aux chercheurs les moyens, grâce à la technologie EDS, de rendre la biologie véritablement programmable et d’accélérer sa révolution. Nous sommes convaincus qu’à l’instar des technologies NGS (lecture de l’ADN) et CRISPR (édition de l’ADN), qui ont permis des avancées significatives dans les domaines de la science et de la santé, la large accessibilité de l’impression d’ADN sur la paillasse (écriture de l’ADN) via leur technologie EDS sera tout aussi transformatrice.

À qui s’adresse ce produit ? 

DNA Script vend ses produits à des équipes de recherche et de développement dans le secteur des sciences de la vie. Il s’agit notamment d’installations de base, de sociétés de séquençage clinique, de sociétés de biologie synthétique et d’acteurs de la biotechnologie et de la biopharmacie.

Nos clients ont besoin d’un approvisionnement régulier d’ADN personnalisé. Ils itèrent rapidement et préfèrent ne pas attendre la livraison d’un fournisseur d’oligo traditionnel ou se débattre avec une chaîne d’approvisionnement surchargée. Les capacités à la demande donnent aux laboratoires les outils et le contrôle nécessaires pour agir et pivoter rapidement.

Quels sont les défis auxquels les jeunes entreprises de votre secteur sont confrontées ? 

Pour comprendre nos défis, il est utile d’établir des parallèles avec les défis auxquels nos clients sont confrontés.

Ces dernières années, les besoins en acides nucléiques (ADN et ARN) dans la recherche en sciences de la vie ont augmenté. Le développement rapide de la médecine personnalisée basée sur la génomique, l’apparition de nouvelles technologies d’édition du génome comme CRISPR-Cas9, la course au développement de vaccins autour du Covid-19, et plus généralement l’intensification des efforts de recherche dans les sciences du vivant ont contribué à cette croissance.

Cependant, cette demande est difficile à satisfaire. La méthode actuelle de synthèse, basée sur la chimie des phosphoramidites, est centralisée auprès d’une poignée de fournisseurs de services tiers auxquels les chercheurs doivent soumettre leurs commandes. De plus, ils doivent aussi attendre des jours, voire des semaines, pour être livrés. Les limites de ce modèle centralisé de production d’ADN et de livraison logistique deviennent facilement apparentes lorsque la demande augmente significativement, par exemple au début de la pandémie de Covid-19. Comme on peut s’y attendre, les grandes organisations passent des commandes plus importantes, et leurs besoins sont souvent prioritaires par rapport aux commandes des petites entreprises. Cet axiome commercial désavantage les jeunes entreprises et leur capacité à innover.

Les startups comme DNA Script sont soumises à une pression intense pour avancer rapidement. Cependant, à l’instar de nos clients, nos besoins en matériaux peuvent ne pas atteindre le volume de commande nécessaire pour être considérée comme prioritaire, ce qui peut ralentir la production, les ventes et la croissance de l’entreprise.

Bien que cela reste un défi pour les startups technologiques comme DNA Script, nous pensons résoudre ce problème pour nos clients dans le domaine de la recherche en sciences de la vie en permettant aux chercheurs travaillant au sein d’organisations de toute taille d’imprimer en interne leurs propres besoins en ADN. L’imprimante de paillasse SYNTAX System alimentée par EDS augmentera la productivité, la découverte et l’innovation grâce à des délais d’exécution plus rapides et à un contrôle accru.

Vous avez levé 172 millions d’euros en janvier 2022. A quoi a servi cette somme ? Où en êtes-vous dans le développement de ce projet ? 

Cette série C permettra à la société de concrétiser notre vision. En faisant de la synthèse enzymatique d’ADN une plateforme technologique sur laquelle reposent de nombreux réactifs et plateformes qui permet des applications sur les marchés de la biotechnologie, du diagnostic et de la thérapie, ainsi que de nouvelles applications telles que le stockage de données ADN. Ces fonds seront également utilisés pour renforcer les équipes lors de la mise en place et de la commercialisation de nos instruments, kits, logiciels et supports.   

Comment fonctionne SYNTAX et la technologie développée par vos équipes ? Avez-vous des concurrents ? Comment vous démarquez-vous ? 

La plupart des laboratoires commandent actuellement leur ADN personnalisé auprès de fabricants tiers en raison de divers facteurs, notamment un processus complexe de chimie phosphoramidite. C’est un processus qui nécessite des chimistes hautement qualifiés. De plus, il est réalisé dans un environnement contrôlé, exempt d’air et d’eau, lequel produit par ailleurs des sous-produits de déchets organiques dangereux. 

Compte tenu de ces obstacles, il n’est pas étonnant que la plupart des laboratoires préfèrent externaliser. Cependant, le prix à payer est élevé : à chaque étape de leur processus de recherche nécessitant des oligo, les chercheurs doivent attendre la livraison de leurs oligo personnalisés, ce qui nuit à l’efficacité et ralentit l’innovation.

En comparaison, la technologie EDS de DNA Script est basée sur la manière dont la biologie synthétise naturellement l’ADN, avec des enzymes et dans un environnement aqueux. Ce processus est plus sûr pour le personnel de laboratoire et plus respectueux de l’environnement que la technologie traditionnelle des phosphoramidites. Dans notre modèle commercial, nous avons mis en œuvre cette meilleure technologie de synthèse dans un instrument de paillasse qui peut être installé dans tous les laboratoires. L’instrument SYNTAX est facile à utiliser. Son installation ne prend que 15 minutes et ne nécessite aucune formation ou compétence particulière. Ainsi, EDS et le système SYNTAX donnent aux chercheurs la possibilité de synthétiser facilement et en toute sécurité de l’ADN personnalisé en interne. Cela leur permet d’itérer plus rapidement, de contrôler leur propre flux de travail, de planifier et d’exécuter efficacement des expériences sans se soucier des délais de livraison imprévisibles.

Comment avez-vous organisé le déploiement international de DNA Script ? 

DNA Script travaille à l’adoption mondiale de son système SYNTAX alimenté par EDS sur plusieurs fronts. Avec le marché américain comme cible principale, l’entreprise a créé une filiale américaine à San Francisco en 2018.

En outre, DNA Script travaille sur plusieurs accords de distribution internationaux. Nous avons récemment annoncé la signature d’accords avec plusieurs sociétés de distribution d’instruments de laboratoire de premier plan dans toute la région Asie-Pacifique. Ces accords permettront d’assurer la vente et le soutien de la plateforme SYNTAX dans leurs pays respectifs.

La société a également signé des accords de collaboration avec plusieurs organisations gouvernementales et initiatives internationales, notamment :

• L’agence française d’innovation de défense, en liaison avec la Direction générale de l’armement (DGA).

L’entreprise travaille avec la DGA pour développer des diagnostics et des thérapeutiques à la demande afin de répondre plus rapidement aux menaces biologiques émergentes.

• Le programme Wellcome Leap R3. 

DNA Script a été sélectionné par Wellcome Leap, un programme international fondé par le Wellcome Trust. Nous travaillons avec d’autres partenaires de Leap au développement d’un système entièrement automatisé et déployable pour accélérer le développement thérapeutique pendant les urgences afin de répondre aux besoins futurs en cas de pandémie au niveau local.

• National Human Genome Research Institute, U.S. National Institutes of Health. 

DNA Script a reçu une subvention du NHGRI pour développer une imprimante ADN de bureau qui fabrique des milliers à des millions d’oligo à la fois — l’échelle nécessaire pour les grands panels d’enrichissement de séquençage de nouvelle génération (NGS) (par exemple, pour le séquençage ciblé et de nombreux flux de travail de diagnostic, tel que la biopsie liquide pour détecter les cellules cancéreuses), la découverte et l’optimisation de médicaments et la synthèse de gènes longs.

• U.S. Defense Advanced Research Projects Agency. 

DNA Script soutient le programme Nucleic Acids On-Demand World-Wide (NOW) de la DARPA. Ce programme vise à développer une plateforme de fabrication mobile et réactive pour diagnostiquer rapidement les menaces de pathogènes et fournir des contre-mesures médicales. Nous avons été sélectionnés séparément par les deux bénéficiaires de la subvention NOW, Moderna et GE Research, pour créer une plateforme déployable capable de produire des centaines ou des milliers de vaccins et de produits thérapeutiques prêts à l’emploi en moins de trois jours, offrant ainsi une protection quasi instantanée au personnel militaire et aux populations locales du monde entier.

• U.S. Intelligence Advanced Research Projects Activity. 

Nous sommes engagées dans un projet de recherche avec le Broad Institute, Harvard et Illumina, financé par l’agence IARPA. Ce projet vise à explorer les promesses potentielles du stockage de données ADN en tant que technologie plus durable, avec des exigences radicalement réduites en matière d’empreinte physique, de puissance et de coût.

• DNA-Fairylights.

Nous sommes engagées dans ce projet international de stockage de données ADN. DNA Fairylights est un projet financé par l’Union européenne dans le cadre du programme Horizon 2020. Son but est de combiner des technologies de pointe en biologie et en sciences des matériaux. Cela afin de permettre des processus de lecture et d’écriture plus rapides et un codage des données inédit. Ce consortium, dans lequel nous représentons la France, est composé d’une équipe interdisciplinaire d’éminents chercheurs d’Italie, d’Espagne, d’Allemagne, de Suisse et du Royaume-Uni.

Que vous apporte votre place au sein de la French Tech 120 ? Comment percevez-vous l’écosystème des start-up en France ? 

Nous sommes ravis de figurer parmi les entreprises de santé Next40, reconnues par le gouvernement français pour notre capacité renforcée à devenir des leaders sur notre marché. 

Quel est votre bilan après 8 ans d’activité ? Quelles sont vos ambitions pour DNA Script ? 

Notre croissance est conforme à notre stratégie. Aussi, nous considérons que notre capacité à attirer des investissements de premier plan tels que BpiFrance, Sofinnova, Fidelity, T. Rowe Price et Baillie Gifford, témoigne de nos progrès et de notre réussite à ce jour.

Depuis sa création, DNA Script a levé 275 millions d’euros et signé plusieurs accords internationaux importants. En outre, nous avons :

  • Ouvert le siège d’une filiale américaine à San Francisco.
  • Testé notre technologie et notre instrument auprès de 40 entreprises afin de concevoir un produit qui répond aux besoins du marché.
  • Lancé la première imprimante commerciale de synthèse enzymatique d’ADN au monde, le système SYNTAX, en juin 2021.
  • Obtenu le marquage CE en novembre 2021.
  • Lancé un programme d’accès anticipé (DNA Scriptors) afin d’accélérer l’expansion des applications de leur système SYNTAX en offrant aux utilisateurs des possibilités permanentes d’accès aux produits avant le lancement commercial complet.

DNA Script a déposé plus de 100 brevets ou demandes de brevet autour des technologies qui permettent la synthèse enzymatique de l’ADN. Nous prévoyons de lancer plusieurs nouveaux kits et améliorations de produits cette année. La société a démarré en 2022 avec environ 150 employés. À ce jour, nous comptons environ 200 employés, et nous avons l’intention de doubler de taille cette année.

La vision de DNA Script est de donner aux chercheurs les moyens de rendre la biologie véritablement programmable, de démocratiser l’accès à la technologie EDS et d’accélérer la biorévolution. Et ce, grâce à la technologie de synthèse enzymatique d’ADN. En permettant un large accès à l’impression d’ADN synthétique depuis notre plateforme SYNTAX, nous aspirons à favoriser de nouvelles découvertes dans la recherche, les soins de santé personnalisés, la thérapeutique, le diagnostic et de nombreux autres domaines vitaux.

 

 Nos remerciements à Thomas Ybert, cofondateur & CEO de DNA Script.
Propos rapportés par l’équipe de manager.one

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